Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRFP10586 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRFP10586 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRFP10586 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRFP10586 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRFP10586 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRFP10586 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRFP10586 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRFP10586 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRFP10586 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRFP10586 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRFP10586 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRFP10586 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRFP10586 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRFP10586 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRFP10586 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRFP10586 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRFP10586 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRFP10586 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRFP10586 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRFP10586 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRFP10586 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRFP10586 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRFP10586 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRFP10586 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRFP10586 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRFP10586 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRFP10586 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRFP10586 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRFP10586 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRFP10586 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRFP10586 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRFP10586 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms