Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM18P0DKX4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM18P0DKX4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMIM18P0DKX4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM18P0DKX4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM18P0DKX4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms