Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACAA1P09110 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACAA1P09110 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACAA1P09110 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACAA1P09110 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACAA1P09110 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms