Protein–RNA interactions for Protein: P04155

TFF1, Trefoil factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF1P04155 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF1P04155 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF1P04155 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF1P04155 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF1P04155 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF1P04155 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF1P04155 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFF1P04155 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFF1P04155 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFF1P04155 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFF1P04155 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFF1P04155 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFF1P04155 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFF1P04155 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFF1P04155 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF1P04155 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF1P04155 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF1P04155 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF1P04155 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF1P04155 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF1P04155 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF1P04155 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF1P04155 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF1P04155 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFF1P04155 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF1P04155 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF1P04155 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF1P04155 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF1P04155 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF1P04155 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFF1P04155 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFF1P04155 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFF1P04155 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFF1P04155 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFF1P04155 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFF1P04155 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFF1P04155 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFF1P04155 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFF1P04155 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFF1P04155 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFF1P04155 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFF1P04155 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFF1P04155 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFF1P04155 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFF1P04155 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFF1P04155 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFF1P04155 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TFF1P04155 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFF1P04155 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFF1P04155 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFF1P04155 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TFF1P04155 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFF1P04155 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFF1P04155 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFF1P04155 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TFF1P04155 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFF1P04155 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TFF1P04155 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TFF1P04155 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFF1P04155 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFF1P04155 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFF1P04155 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFF1P04155 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFF1P04155 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFF1P04155 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFF1P04155 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFF1P04155 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFF1P04155 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFF1P04155 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFF1P04155 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFF1P04155 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TFF1P04155 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFF1P04155 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFF1P04155 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFF1P04155 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFF1P04155 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFF1P04155 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TFF1P04155 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFF1P04155 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFF1P04155 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFF1P04155 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFF1P04155 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFF1P04155 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFF1P04155 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFF1P04155 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFF1P04155 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFF1P04155 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFF1P04155 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFF1P04155 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFF1P04155 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFF1P04155 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFF1P04155 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFF1P04155 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFF1P04155 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFF1P04155 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFF1P04155 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFF1P04155 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFF1P04155 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFF1P04155 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFF1P04155 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms