Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ESR1P03372 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ESR1P03372 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ESR1P03372 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ESR1P03372 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ESR1P03372 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ESR1P03372 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ESR1P03372 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ESR1P03372 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ESR1P03372 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ESR1P03372 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ESR1P03372 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ESR1P03372 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ESR1P03372 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ESR1P03372 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ESR1P03372 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ESR1P03372 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ESR1P03372 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ESR1P03372 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ESR1P03372 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ESR1P03372 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ESR1P03372 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ESR1P03372 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ESR1P03372 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ESR1P03372 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ESR1P03372 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ESR1P03372 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ESR1P03372 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ESR1P03372 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ESR1P03372 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ESR1P03372 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ESR1P03372 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ESR1P03372 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ESR1P03372 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ESR1P03372 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ESR1P03372 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ESR1P03372 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ESR1P03372 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ESR1P03372 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ESR1P03372 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ESR1P03372 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ESR1P03372 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ESR1P03372 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ESR1P03372 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESR1P03372 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESR1P03372 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESR1P03372 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ESR1P03372 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESR1P03372 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ESR1P03372 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ESR1P03372 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ESR1P03372 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ESR1P03372 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ESR1P03372 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ESR1P03372 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ESR1P03372 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ESR1P03372 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ESR1P03372 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ESR1P03372 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ESR1P03372 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ESR1P03372 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ESR1P03372 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ESR1P03372 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ESR1P03372 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ESR1P03372 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ESR1P03372 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ESR1P03372 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ESR1P03372 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ESR1P03372 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ESR1P03372 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ESR1P03372 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ESR1P03372 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ESR1P03372 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ESR1P03372 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ESR1P03372 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ESR1P03372 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ESR1P03372 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ESR1P03372 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ESR1P03372 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ESR1P03372 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ESR1P03372 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ESR1P03372 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESR1P03372 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESR1P03372 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESR1P03372 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESR1P03372 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ESR1P03372 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ESR1P03372 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ESR1P03372 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ESR1P03372 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ESR1P03372 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ESR1P03372 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ESR1P03372 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ESR1P03372 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ESR1P03372 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ESR1P03372 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ESR1P03372 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ESR1P03372 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ESR1P03372 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ESR1P03372 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms