Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNAP02545 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNAP02545 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNAP02545 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNAP02545 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNAP02545 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNAP02545 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNAP02545 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNAP02545 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNAP02545 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNAP02545 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNAP02545 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNAP02545 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNAP02545 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNAP02545 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMNAP02545 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNAP02545 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNAP02545 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNAP02545 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNAP02545 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNAP02545 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNAP02545 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNAP02545 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNAP02545 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNAP02545 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNAP02545 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNAP02545 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNAP02545 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNAP02545 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNAP02545 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNAP02545 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMNAP02545 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMNAP02545 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMNAP02545 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMNAP02545 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNAP02545 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNAP02545 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNAP02545 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNAP02545 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNAP02545 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNAP02545 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNAP02545 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNAP02545 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNAP02545 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNAP02545 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNAP02545 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNAP02545 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNAP02545 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNAP02545 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNAP02545 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNAP02545 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNAP02545 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNAP02545 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNAP02545 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNAP02545 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNAP02545 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNAP02545 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNAP02545 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNAP02545 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNAP02545 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNAP02545 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNAP02545 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNAP02545 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMNAP02545 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMNAP02545 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNAP02545 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNAP02545 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNAP02545 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNAP02545 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNAP02545 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNAP02545 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNAP02545 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNAP02545 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNAP02545 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNAP02545 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNAP02545 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNAP02545 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNAP02545 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMNAP02545 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMNAP02545 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMNAP02545 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMNAP02545 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNAP02545 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNAP02545 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNAP02545 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNAP02545 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNAP02545 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNAP02545 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNAP02545 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNAP02545 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNAP02545 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNAP02545 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNAP02545 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNAP02545 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNAP02545 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNAP02545 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNAP02545 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNAP02545 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNAP02545 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNAP02545 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms