Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPP00450 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPP00450 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPP00450 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPP00450 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPP00450 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPP00450 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPP00450 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPP00450 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPP00450 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPP00450 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPP00450 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPP00450 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPP00450 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPP00450 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPP00450 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPP00450 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPP00450 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPP00450 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CPP00450 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CPP00450 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPP00450 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPP00450 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPP00450 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPP00450 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPP00450 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPP00450 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPP00450 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPP00450 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPP00450 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPP00450 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPP00450 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPP00450 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPP00450 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPP00450 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPP00450 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CPP00450 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPP00450 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPP00450 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPP00450 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPP00450 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPP00450 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPP00450 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPP00450 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPP00450 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPP00450 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPP00450 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPP00450 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPP00450 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPP00450 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPP00450 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPP00450 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CPP00450 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPP00450 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPP00450 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPP00450 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPP00450 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPP00450 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CPP00450 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPP00450 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPP00450 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPP00450 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPP00450 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPP00450 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPP00450 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPP00450 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPP00450 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPP00450 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPP00450 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPP00450 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPP00450 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPP00450 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPP00450 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CPP00450 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPP00450 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPP00450 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPP00450 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPP00450 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPP00450 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CPP00450 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPP00450 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPP00450 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPP00450 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPP00450 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPP00450 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPP00450 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPP00450 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPP00450 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPP00450 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPP00450 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPP00450 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPP00450 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CPP00450 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPP00450 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPP00450 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPP00450 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPP00450 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPP00450 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPP00450 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPP00450 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms