Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX6O95475 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX6O95475 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX6O95475 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX6O95475 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX6O95475 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX6O95475 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX6O95475 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX6O95475 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIX6O95475 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIX6O95475 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX6O95475 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX6O95475 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX6O95475 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX6O95475 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX6O95475 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX6O95475 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX6O95475 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX6O95475 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX6O95475 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX6O95475 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX6O95475 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX6O95475 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX6O95475 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIX6O95475 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIX6O95475 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX6O95475 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX6O95475 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX6O95475 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX6O95475 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX6O95475 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX6O95475 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX6O95475 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX6O95475 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX6O95475 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX6O95475 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX6O95475 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX6O95475 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX6O95475 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX6O95475 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX6O95475 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX6O95475 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX6O95475 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIX6O95475 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX6O95475 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX6O95475 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX6O95475 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX6O95475 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX6O95475 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIX6O95475 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX6O95475 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX6O95475 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIX6O95475 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX6O95475 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIX6O95475 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX6O95475 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX6O95475 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX6O95475 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX6O95475 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX6O95475 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX6O95475 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX6O95475 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX6O95475 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX6O95475 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX6O95475 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX6O95475 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX6O95475 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX6O95475 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX6O95475 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX6O95475 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX6O95475 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX6O95475 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX6O95475 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX6O95475 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX6O95475 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX6O95475 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX6O95475 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX6O95475 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX6O95475 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX6O95475 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX6O95475 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX6O95475 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX6O95475 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX6O95475 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX6O95475 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX6O95475 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX6O95475 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX6O95475 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX6O95475 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX6O95475 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX6O95475 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX6O95475 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX6O95475 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX6O95475 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX6O95475 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX6O95475 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX6O95475 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX6O95475 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX6O95475 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX6O95475 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms