Protein–RNA interactions for Protein: O94993

SOX30, Transcription factor SOX-30, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX30O94993 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX30O94993 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX30O94993 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX30O94993 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX30O94993 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX30O94993 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX30O94993 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX30O94993 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX30O94993 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX30O94993 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX30O94993 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX30O94993 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX30O94993 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX30O94993 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX30O94993 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX30O94993 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX30O94993 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX30O94993 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX30O94993 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX30O94993 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX30O94993 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX30O94993 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SOX30O94993 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SOX30O94993 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SOX30O94993 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX30O94993 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX30O94993 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX30O94993 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX30O94993 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX30O94993 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX30O94993 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX30O94993 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX30O94993 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX30O94993 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX30O94993 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX30O94993 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX30O94993 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX30O94993 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX30O94993 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX30O94993 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX30O94993 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX30O94993 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX30O94993 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX30O94993 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX30O94993 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX30O94993 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX30O94993 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX30O94993 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX30O94993 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX30O94993 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX30O94993 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX30O94993 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX30O94993 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX30O94993 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX30O94993 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX30O94993 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX30O94993 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX30O94993 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX30O94993 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX30O94993 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX30O94993 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX30O94993 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX30O94993 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX30O94993 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX30O94993 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX30O94993 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX30O94993 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX30O94993 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX30O94993 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX30O94993 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX30O94993 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX30O94993 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX30O94993 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX30O94993 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX30O94993 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX30O94993 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX30O94993 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX30O94993 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX30O94993 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX30O94993 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX30O94993 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX30O94993 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX30O94993 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SOX30O94993 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX30O94993 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX30O94993 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX30O94993 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX30O94993 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX30O94993 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX30O94993 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX30O94993 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX30O94993 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX30O94993 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX30O94993 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX30O94993 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX30O94993 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX30O94993 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX30O94993 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX30O94993 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX30O94993 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms