Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC19A2O60779 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC19A2O60779 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC19A2O60779 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC19A2O60779 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC19A2O60779 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A2O60779 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A2O60779 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A2O60779 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC19A2O60779 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms