Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLOCKO15516 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLOCKO15516 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLOCKO15516 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLOCKO15516 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLOCKO15516 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms