Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCF2LO15068 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCF2LO15068 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCF2LO15068 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCF2LO15068 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCF2LO15068 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCF2LO15068 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2LO15068 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms