Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
APAF1O14727 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
APAF1O14727 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
APAF1O14727 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
APAF1O14727 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
APAF1O14727 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
APAF1O14727 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
APAF1O14727 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
APAF1O14727 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
APAF1O14727 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
APAF1O14727 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
APAF1O14727 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
APAF1O14727 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
APAF1O14727 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
APAF1O14727 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
APAF1O14727 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
APAF1O14727 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
APAF1O14727 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
APAF1O14727 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
APAF1O14727 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
APAF1O14727 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
APAF1O14727 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
APAF1O14727 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
APAF1O14727 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
APAF1O14727 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
APAF1O14727 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
APAF1O14727 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
APAF1O14727 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
APAF1O14727 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
APAF1O14727 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
APAF1O14727 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
APAF1O14727 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
APAF1O14727 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
APAF1O14727 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
APAF1O14727 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
APAF1O14727 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
APAF1O14727 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
APAF1O14727 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
APAF1O14727 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
APAF1O14727 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
APAF1O14727 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
APAF1O14727 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
APAF1O14727 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
APAF1O14727 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
APAF1O14727 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
APAF1O14727 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
APAF1O14727 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
APAF1O14727 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
APAF1O14727 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
APAF1O14727 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
APAF1O14727 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
APAF1O14727 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
APAF1O14727 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
APAF1O14727 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
APAF1O14727 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
APAF1O14727 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
APAF1O14727 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
APAF1O14727 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
APAF1O14727 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
APAF1O14727 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
APAF1O14727 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
APAF1O14727 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
APAF1O14727 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
APAF1O14727 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
APAF1O14727 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
APAF1O14727 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
APAF1O14727 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
APAF1O14727 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
APAF1O14727 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
APAF1O14727 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
APAF1O14727 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
APAF1O14727 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
APAF1O14727 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
APAF1O14727 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
APAF1O14727 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
APAF1O14727 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
APAF1O14727 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
APAF1O14727 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
APAF1O14727 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
APAF1O14727 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
APAF1O14727 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
APAF1O14727 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
APAF1O14727 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
APAF1O14727 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
APAF1O14727 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
APAF1O14727 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
APAF1O14727 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
APAF1O14727 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
APAF1O14727 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
APAF1O14727 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
APAF1O14727 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
APAF1O14727 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
APAF1O14727 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
APAF1O14727 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
APAF1O14727 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
APAF1O14727 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
APAF1O14727 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
APAF1O14727 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
APAF1O14727 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
APAF1O14727 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms