Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B8ZZF3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B8ZZF3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B8ZZF3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B8ZZF3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B8ZZF3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B8ZZF3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B8ZZF3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B8ZZF3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B8ZZF3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B8ZZF3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B8ZZF3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B8ZZF3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B8ZZF3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B8ZZF3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B8ZZF3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B8ZZF3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B8ZZF3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
B8ZZF3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
B8ZZF3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B8ZZF3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B8ZZF3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B8ZZF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
B8ZZF3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B8ZZF3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B8ZZF3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B8ZZF3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B8ZZF3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B8ZZF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B8ZZF3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B8ZZF3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B8ZZF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B8ZZF3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B8ZZF3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B8ZZF3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
B8ZZF3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B8ZZF3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B8ZZF3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B8ZZF3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B8ZZF3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B8ZZF3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B8ZZF3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
B8ZZF3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B8ZZF3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B8ZZF3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B8ZZF3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B8ZZF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B8ZZF3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B8ZZF3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B8ZZF3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
B8ZZF3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B8ZZF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B8ZZF3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B8ZZF3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B8ZZF3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B8ZZF3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B8ZZF3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B8ZZF3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B8ZZF3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B8ZZF3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B8ZZF3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B8ZZF3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B8ZZF3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B8ZZF3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B8ZZF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B8ZZF3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B8ZZF3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B8ZZF3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
B8ZZF3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B8ZZF3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B8ZZF3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B8ZZF3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B8ZZF3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
B8ZZF3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B8ZZF3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B8ZZF3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B8ZZF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B8ZZF3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B8ZZF3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B8ZZF3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B8ZZF3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B8ZZF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B8ZZF3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B8ZZF3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B8ZZF3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B8ZZF3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B8ZZF3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B8ZZF3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B8ZZF3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B8ZZF3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B8ZZF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B8ZZF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
B8ZZF3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B8ZZF3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B8ZZF3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B8ZZF3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B8ZZF3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B8ZZF3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B8ZZF3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
B8ZZF3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B8ZZF3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms