Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC189A1A4V9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC189A1A4V9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC189A1A4V9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC189A1A4V9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC189A1A4V9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC189A1A4V9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC189A1A4V9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC189A1A4V9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC189A1A4V9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC189A1A4V9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC189A1A4V9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC189A1A4V9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC189A1A4V9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC189A1A4V9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC189A1A4V9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC189A1A4V9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC189A1A4V9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms