Protein–RNA interactions for Protein: A0A088AWK7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A088AWK7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A088AWK7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A088AWK7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A088AWK7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A088AWK7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A088AWK7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A088AWK7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A088AWK7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A088AWK7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms