Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WV48

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WV48 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087WV48 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WV48 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087WV48 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WV48 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WV48 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WV48 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087WV48 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WV48 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A087WV48 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WV48 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WV48 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WV48 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WV48 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WV48 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WV48 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WV48 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WV48 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WV48 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A087WV48 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087WV48 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087WV48 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A087WV48 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A087WV48 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WV48 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A087WV48 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WV48 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WV48 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WV48 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WV48 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A087WV48 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A087WV48 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A087WV48 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A087WV48 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A087WV48 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WV48 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WV48 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WV48 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087WV48 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WV48 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WV48 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087WV48 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WV48 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WV48 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087WV48 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WV48 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087WV48 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087WV48 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087WV48 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A087WV48 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A087WV48 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WV48 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WV48 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087WV48 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WV48 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WV48 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WV48 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WV48 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WV48 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WV48 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087WV48 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WV48 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WV48 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087WV48 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087WV48 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087WV48 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WV48 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087WV48 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WV48 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WV48 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WV48 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WV48 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WV48 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087WV48 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A087WV48 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A087WV48 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A087WV48 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A087WV48 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A087WV48 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A087WV48 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A087WV48 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A087WV48 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A087WV48 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A087WV48 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A087WV48 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A087WV48 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087WV48 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087WV48 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087WV48 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087WV48 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087WV48 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087WV48 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087WV48 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A087WV48 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A087WV48 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A087WV48 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A087WV48 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A087WV48 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A087WV48 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A087WV48 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms