Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX13Q9Y5W8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX13Q9Y5W8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX13Q9Y5W8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX13Q9Y5W8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX13Q9Y5W8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX13Q9Y5W8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms