Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5N1

HRH3, Histamine H3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH3Q9Y5N1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HRH3Q9Y5N1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HRH3Q9Y5N1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HRH3Q9Y5N1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HRH3Q9Y5N1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HRH3Q9Y5N1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HRH3Q9Y5N1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRH3Q9Y5N1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRH3Q9Y5N1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HRH3Q9Y5N1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HRH3Q9Y5N1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRH3Q9Y5N1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRH3Q9Y5N1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms