Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G7

PCDHGA6, Protocadherin gamma-A6, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA6Q9Y5G7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCDHGA6Q9Y5G7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCDHGA6Q9Y5G7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGA6Q9Y5G7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGA6Q9Y5G7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCDHGA6Q9Y5G7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHGA6Q9Y5G7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHGA6Q9Y5G7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGA6Q9Y5G7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGA6Q9Y5G7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA6Q9Y5G7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGA6Q9Y5G7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms