Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHGA8Q9Y5G5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHGA8Q9Y5G5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHGA8Q9Y5G5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDHGA8Q9Y5G5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHGA8Q9Y5G5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHGA8Q9Y5G5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHGA8Q9Y5G5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms