Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RAPGEF2Q9Y4G8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
RAPGEF2Q9Y4G8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
RAPGEF2Q9Y4G8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
RAPGEF2Q9Y4G8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
RAPGEF2Q9Y4G8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC44.27■■■■■ 4.68
RAPGEF2Q9Y4G8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
RAPGEF2Q9Y4G8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
RAPGEF2Q9Y4G8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
RAPGEF2Q9Y4G8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
RAPGEF2Q9Y4G8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
RAPGEF2Q9Y4G8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
RAPGEF2Q9Y4G8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
RAPGEF2Q9Y4G8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
RAPGEF2Q9Y4G8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
RAPGEF2Q9Y4G8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
RAPGEF2Q9Y4G8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
RAPGEF2Q9Y4G8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
RAPGEF2Q9Y4G8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
RAPGEF2Q9Y4G8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
RAPGEF2Q9Y4G8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC44.14■■■■■ 4.66
RAPGEF2Q9Y4G8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.13■■■■■ 4.66
RAPGEF2Q9Y4G8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.13■■■■■ 4.66
RAPGEF2Q9Y4G8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
RAPGEF2Q9Y4G8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
RAPGEF2Q9Y4G8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
RAPGEF2Q9Y4G8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
RAPGEF2Q9Y4G8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
RAPGEF2Q9Y4G8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
RAPGEF2Q9Y4G8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
RAPGEF2Q9Y4G8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
RAPGEF2Q9Y4G8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
RAPGEF2Q9Y4G8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
RAPGEF2Q9Y4G8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
RAPGEF2Q9Y4G8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
RAPGEF2Q9Y4G8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
RAPGEF2Q9Y4G8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
RAPGEF2Q9Y4G8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
RAPGEF2Q9Y4G8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RAPGEF2Q9Y4G8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RAPGEF2Q9Y4G8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RAPGEF2Q9Y4G8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
RAPGEF2Q9Y4G8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
RAPGEF2Q9Y4G8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
RAPGEF2Q9Y4G8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
RAPGEF2Q9Y4G8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
RAPGEF2Q9Y4G8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
RAPGEF2Q9Y4G8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
RAPGEF2Q9Y4G8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RAPGEF2Q9Y4G8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.89■■■■■ 4.62
RAPGEF2Q9Y4G8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
RAPGEF2Q9Y4G8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
RAPGEF2Q9Y4G8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RAPGEF2Q9Y4G8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RAPGEF2Q9Y4G8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RAPGEF2Q9Y4G8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RAPGEF2Q9Y4G8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RAPGEF2Q9Y4G8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
RAPGEF2Q9Y4G8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RAPGEF2Q9Y4G8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC43.71■■■■■ 4.59
RAPGEF2Q9Y4G8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
RAPGEF2Q9Y4G8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
RAPGEF2Q9Y4G8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RAPGEF2Q9Y4G8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RAPGEF2Q9Y4G8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.64■■■■■ 4.58
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.64■■■■■ 4.58
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
RAPGEF2Q9Y4G8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
RAPGEF2Q9Y4G8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms