Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PDZRN3Q9UPQ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDZRN3Q9UPQ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDZRN3Q9UPQ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDZRN3Q9UPQ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDZRN3Q9UPQ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PDZRN3Q9UPQ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDZRN3Q9UPQ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDZRN3Q9UPQ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDZRN3Q9UPQ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDZRN3Q9UPQ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDZRN3Q9UPQ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDZRN3Q9UPQ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDZRN3Q9UPQ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDZRN3Q9UPQ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDZRN3Q9UPQ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDZRN3Q9UPQ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDZRN3Q9UPQ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDZRN3Q9UPQ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDZRN3Q9UPQ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PDZRN3Q9UPQ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PDZRN3Q9UPQ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PDZRN3Q9UPQ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PDZRN3Q9UPQ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PDZRN3Q9UPQ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PDZRN3Q9UPQ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PDZRN3Q9UPQ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PDZRN3Q9UPQ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDZRN3Q9UPQ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PDZRN3Q9UPQ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDZRN3Q9UPQ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDZRN3Q9UPQ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDZRN3Q9UPQ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDZRN3Q9UPQ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PDZRN3Q9UPQ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDZRN3Q9UPQ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDZRN3Q9UPQ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PDZRN3Q9UPQ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDZRN3Q9UPQ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDZRN3Q9UPQ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDZRN3Q9UPQ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDZRN3Q9UPQ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDZRN3Q9UPQ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDZRN3Q9UPQ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms