Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM33Q9UPN9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM33Q9UPN9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM33Q9UPN9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM33Q9UPN9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM33Q9UPN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM33Q9UPN9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM33Q9UPN9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM33Q9UPN9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM33Q9UPN9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM33Q9UPN9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM33Q9UPN9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM33Q9UPN9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM33Q9UPN9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM33Q9UPN9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM33Q9UPN9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM33Q9UPN9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms