Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCDHA12Q9UN75 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PCDHA12Q9UN75 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCDHA12Q9UN75 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCDHA12Q9UN75 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCDHA12Q9UN75 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCDHA12Q9UN75 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCDHA12Q9UN75 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDHA12Q9UN75 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCDHA12Q9UN75 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHA12Q9UN75 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHA12Q9UN75 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHA12Q9UN75 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCDHA12Q9UN75 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCDHA12Q9UN75 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PCDHA12Q9UN75 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDHA12Q9UN75 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCDHA12Q9UN75 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDHA12Q9UN75 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDHA12Q9UN75 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCDHA12Q9UN75 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms