Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHLA2Q9UM44 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HHLA2Q9UM44 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HHLA2Q9UM44 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HHLA2Q9UM44 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HHLA2Q9UM44 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HHLA2Q9UM44 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHLA2Q9UM44 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHLA2Q9UM44 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HHLA2Q9UM44 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms