Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRPF3Q9ULD4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BRPF3Q9ULD4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRPF3Q9ULD4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRPF3Q9ULD4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRPF3Q9ULD4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRPF3Q9ULD4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRPF3Q9ULD4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRPF3Q9ULD4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
BRPF3Q9ULD4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRPF3Q9ULD4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
BRPF3Q9ULD4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BRPF3Q9ULD4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BRPF3Q9ULD4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRPF3Q9ULD4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRPF3Q9ULD4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRPF3Q9ULD4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRPF3Q9ULD4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRPF3Q9ULD4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
BRPF3Q9ULD4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRPF3Q9ULD4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRPF3Q9ULD4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRPF3Q9ULD4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRPF3Q9ULD4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRPF3Q9ULD4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
BRPF3Q9ULD4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
BRPF3Q9ULD4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BRPF3Q9ULD4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BRPF3Q9ULD4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
BRPF3Q9ULD4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
BRPF3Q9ULD4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRPF3Q9ULD4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
BRPF3Q9ULD4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms