Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKN2A-AS1Q9UH64 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN2A-AS1Q9UH64 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN2A-AS1Q9UH64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN2A-AS1Q9UH64 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms