Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX4Q9UBX2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUX4Q9UBX2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX4Q9UBX2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUX4Q9UBX2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DUX4Q9UBX2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUX4Q9UBX2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms