Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNIH4Q9P003 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNIH4Q9P003 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNIH4Q9P003 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNIH4Q9P003 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNIH4Q9P003 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNIH4Q9P003 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNIH4Q9P003 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNIH4Q9P003 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNIH4Q9P003 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNIH4Q9P003 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNIH4Q9P003 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNIH4Q9P003 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNIH4Q9P003 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNIH4Q9P003 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms