Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1Q9NZ71 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RTEL1Q9NZ71 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RTEL1Q9NZ71 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RTEL1Q9NZ71 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RTEL1Q9NZ71 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RTEL1Q9NZ71 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RTEL1Q9NZ71 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms