Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
FANCIQ9NVI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FANCIQ9NVI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FANCIQ9NVI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCIQ9NVI1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCIQ9NVI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCIQ9NVI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FANCIQ9NVI1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FANCIQ9NVI1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FANCIQ9NVI1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FANCIQ9NVI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FANCIQ9NVI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FANCIQ9NVI1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FANCIQ9NVI1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FANCIQ9NVI1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FANCIQ9NVI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FANCIQ9NVI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FANCIQ9NVI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FANCIQ9NVI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FANCIQ9NVI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FANCIQ9NVI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FANCIQ9NVI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCIQ9NVI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCIQ9NVI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCIQ9NVI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCIQ9NVI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCIQ9NVI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCIQ9NVI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCIQ9NVI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FANCIQ9NVI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
FANCIQ9NVI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FANCIQ9NVI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FANCIQ9NVI1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FANCIQ9NVI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FANCIQ9NVI1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FANCIQ9NVI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FANCIQ9NVI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FANCIQ9NVI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FANCIQ9NVI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FANCIQ9NVI1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FANCIQ9NVI1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCIQ9NVI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms