Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A9Q9NUM3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC39A9Q9NUM3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC39A9Q9NUM3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC39A9Q9NUM3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms