Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNBIP1Q9NSA3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms