Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARFGAP3Q9NP61 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARFGAP3Q9NP61 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGAP3Q9NP61 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARFGAP3Q9NP61 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARFGAP3Q9NP61 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARFGAP3Q9NP61 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARFGAP3Q9NP61 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARFGAP3Q9NP61 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARFGAP3Q9NP61 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms