Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41L5Q9HCM4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EPB41L5Q9HCM4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EPB41L5Q9HCM4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPB41L5Q9HCM4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPB41L5Q9HCM4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPB41L5Q9HCM4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPB41L5Q9HCM4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPB41L5Q9HCM4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPB41L5Q9HCM4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPB41L5Q9HCM4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPB41L5Q9HCM4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPB41L5Q9HCM4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPB41L5Q9HCM4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPB41L5Q9HCM4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms