Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
UPF2Q9HAU5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
UPF2Q9HAU5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
UPF2Q9HAU5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
UPF2Q9HAU5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
UPF2Q9HAU5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
UPF2Q9HAU5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
UPF2Q9HAU5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
UPF2Q9HAU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
UPF2Q9HAU5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UPF2Q9HAU5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
UPF2Q9HAU5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
UPF2Q9HAU5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
UPF2Q9HAU5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
UPF2Q9HAU5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
UPF2Q9HAU5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
UPF2Q9HAU5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UPF2Q9HAU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UPF2Q9HAU5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
UPF2Q9HAU5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
UPF2Q9HAU5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
UPF2Q9HAU5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
UPF2Q9HAU5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
UPF2Q9HAU5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
UPF2Q9HAU5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
UPF2Q9HAU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
UPF2Q9HAU5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UPF2Q9HAU5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
UPF2Q9HAU5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms