Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAE3

EFCAB1, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB1Q9HAE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB1Q9HAE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB1Q9HAE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFCAB1Q9HAE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB1Q9HAE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFCAB1Q9HAE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFCAB1Q9HAE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFCAB1Q9HAE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EFCAB1Q9HAE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB1Q9HAE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB1Q9HAE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB1Q9HAE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB1Q9HAE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB1Q9HAE3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB1Q9HAE3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB1Q9HAE3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFCAB1Q9HAE3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFCAB1Q9HAE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFCAB1Q9HAE3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFCAB1Q9HAE3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB1Q9HAE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFCAB1Q9HAE3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB1Q9HAE3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB1Q9HAE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EFCAB1Q9HAE3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFCAB1Q9HAE3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB1Q9HAE3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFCAB1Q9HAE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB1Q9HAE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFCAB1Q9HAE3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFCAB1Q9HAE3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms