Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHARPINQ9H0F6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHARPINQ9H0F6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHARPINQ9H0F6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHARPINQ9H0F6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHARPINQ9H0F6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms