Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAIP1Q9H074 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAIP1Q9H074 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAIP1Q9H074 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAIP1Q9H074 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAIP1Q9H074 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAIP1Q9H074 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAIP1Q9H074 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAIP1Q9H074 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAIP1Q9H074 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAIP1Q9H074 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAIP1Q9H074 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAIP1Q9H074 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAIP1Q9H074 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAIP1Q9H074 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAIP1Q9H074 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAIP1Q9H074 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms