Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C20orf27Q9GZN8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C20orf27Q9GZN8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C20orf27Q9GZN8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C20orf27Q9GZN8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C20orf27Q9GZN8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C20orf27Q9GZN8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C20orf27Q9GZN8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C20orf27Q9GZN8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C20orf27Q9GZN8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C20orf27Q9GZN8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C20orf27Q9GZN8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C20orf27Q9GZN8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C20orf27Q9GZN8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C20orf27Q9GZN8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C20orf27Q9GZN8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C20orf27Q9GZN8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C20orf27Q9GZN8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C20orf27Q9GZN8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C20orf27Q9GZN8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C20orf27Q9GZN8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms