Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BARHL1Q9BZE3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARHL1Q9BZE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BARHL1Q9BZE3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL1Q9BZE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL1Q9BZE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARHL1Q9BZE3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms