Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC3Q9BY71 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC3Q9BY71 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC3Q9BY71 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC3Q9BY71 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC3Q9BY71 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC3Q9BY71 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC3Q9BY71 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC3Q9BY71 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC3Q9BY71 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC3Q9BY71 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC3Q9BY71 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC3Q9BY71 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC3Q9BY71 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC3Q9BY71 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC3Q9BY71 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC3Q9BY71 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC3Q9BY71 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC3Q9BY71 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms