Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBS2Q9BXC9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BBS2Q9BXC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BBS2Q9BXC9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BBS2Q9BXC9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BBS2Q9BXC9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BBS2Q9BXC9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BBS2Q9BXC9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BBS2Q9BXC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BBS2Q9BXC9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BBS2Q9BXC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BBS2Q9BXC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BBS2Q9BXC9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BBS2Q9BXC9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms