Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED9Q9BVK6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMED9Q9BVK6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMED9Q9BVK6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMED9Q9BVK6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMED9Q9BVK6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMED9Q9BVK6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMED9Q9BVK6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMED9Q9BVK6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED9Q9BVK6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMED9Q9BVK6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED9Q9BVK6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED9Q9BVK6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED9Q9BVK6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms