Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MKNK1Q9BUB5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MKNK1Q9BUB5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKNK1Q9BUB5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MKNK1Q9BUB5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MKNK1Q9BUB5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKNK1Q9BUB5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKNK1Q9BUB5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKNK1Q9BUB5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms