Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3CQ99985 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3CQ99985 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3CQ99985 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3CQ99985 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3CQ99985 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3CQ99985 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3CQ99985 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3CQ99985 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3CQ99985 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3CQ99985 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SEMA3CQ99985 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEMA3CQ99985 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA3CQ99985 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3CQ99985 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3CQ99985 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3CQ99985 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms