Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3GL1Q99961 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3GL1Q99961 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3GL1Q99961 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL1Q99961 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL1Q99961 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL1Q99961 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3GL1Q99961 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3GL1Q99961 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3GL1Q99961 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3GL1Q99961 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL1Q99961 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL1Q99961 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL1Q99961 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL1Q99961 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GL1Q99961 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GL1Q99961 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3GL1Q99961 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH3GL1Q99961 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3GL1Q99961 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3GL1Q99961 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms