Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NPAS2Q99743 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NPAS2Q99743 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPAS2Q99743 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAS2Q99743 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPAS2Q99743 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms