Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDRT15Q96T59 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDRT15Q96T59 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDRT15Q96T59 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDRT15Q96T59 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDRT15Q96T59 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDRT15Q96T59 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDRT15Q96T59 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDRT15Q96T59 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDRT15Q96T59 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDRT15Q96T59 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDRT15Q96T59 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDRT15Q96T59 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDRT15Q96T59 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDRT15Q96T59 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDRT15Q96T59 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms